Proteome-pI - Proteome Isoelectric Point Database statistics

Pseudomonas fulva (strain 12-X)

Taxonomy: cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas putida group; Pseudomonas fulva

Average proteome isoelectric point is 6.43

Get precalculated fractions of proteins

Acidic

pI < 6.8

6.8-7.4

pI > 7.4

Basic

All

Virtual 2D-PAGE plot for 4,459 proteins (isoelectric point calculated using IPC_method)

Get csv file with sequences according given criteria:

* You can choose from 18 different methods for calculating isoelectric point

Protein with the lowest isoelectric point:

>tr|F6AAV6|F6AAV6_PSEF1 Type 1 secretion target domain protein 

MSNFAAVIKSLIGQVFVTSVDGVRRQVFEGDRIFAGEQVTTADGGSVTLEMANGETVKLGANASWQAGNPDAQEVADSASQAPVSEFEQALAAGMDPTVDLDPTAAGPGAGGGGGSAGGGHSAVMLSETAQRVDPTIGFQTTGLGTPGFNLIEDNNPAIFATADAADTGTTTPDTTAPVVTIGINPITGD
DILNSAELGAATVTITGTVGGEAKVGDAITLNLGGNVYNGTVIALGNGALGFSIPVSSADLGSFNSISATVSSSDAAGNVGTATASRPYTVDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGSTVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNIGSATDTGAIDTTAPVP
TISLDANITPDDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKNFTGQVQADKTFSINVPGADLVADAGKTINASISTTDAAGNLGSAATSEGYSVDVTAPVPTISLDANITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKTFTGQVQADKTFSINVPGADLVADAGKTINASISTTDA
AGNVGSAATSEGYSVDVTAPAPTITLDANITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKDFTGSVATNPNGTLGFSINVPGADLVADAGKTINASISTTDAAGNIGTATDSEGYRVDVTAPAITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPAGSTVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPL
AEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPAGSTVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGSTVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYS
VDAKATDAAGNTGSATDTGAIDTTAPLITVDAPAVTNDTTPTIVGTTDAPVGSIVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGNTVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVT
DAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPSIVGTTDAPIGSVVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGSTVILTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNI
GSATDTGAINTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPAGSIVTLTVTQGSTVISVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYSVDAKVTDPAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAVTNDTTPTIVGTTDAPVGSTVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDT
GAIDTTAPVITVDAPAVTNDTTPTIVGTTDAPVGSIVTLTITQGTTVLTTTAIVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPTITNDTTPTIVGTTDAPVGSIVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDIGAIDTT
APVPTISLDANITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLNVNGKTFTGQVQADKTFSINVPGADLVADASKTINASISTTDAAGNIGTATDSEGYSVDVTAPVPTISLDANITADDVINSTEATEQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLSVNGKTFTGQVQADKTFSINVPGADLVADAGKTINASIS
TTDAAGNIGTATDSEGYSVNTTLPVPTITLDTNITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKQFTGQVQADKTFSINVPGADLIADAGKTINASISTTDAAGNIGTATDSEGYSVDVTPPSAAIDIVKISEDTGTPGDFVTRDNTLTVSGTVGPLASGEKAQISVDGGNTWTDLNVNNGT
WDYTDGRTLSLGDHTYQVRVVDAAGNLGSTDTQKVTIIANQNPVAVNDPGNAAGLTGQYYAYHEGTNLDGPNLSSLAQVRAFIDANSPDASFVAKNINYSLGGGDLGGNNNLQTFLGSDAASLNVDPENSSDAIIKLSGTLQLQAGSYQFQVRADDGYSISIDGVIVSRFDGNQSPSTNSGSFTISEPGA
HTIEIIYWDQGGQAALQPTLSFAGGAYQPLSNFSPTQANPALVTGHDNALTISQATLLANDSDADGDTLRIVGVDNPKHGTVTLNDNGTITFTPASNYYGPASFSYTVSDGNGGTSTATVTVNVTGDAAPSIGAVSNAVDSSGNQVDEGDNAVFTVNLSNASITSTTFSLSLNAGTAKAGSDYNGTLTNQ
SFSNGVTYNTANGTVTVPAGVSSFTVTVPTINDTISESTETFSLTVGGKSGTATIIDNDGVPTVSAVSSAVDSTGGQVDEGDNAVFTVNLTNAGSTPTTFSLSLNAGTATAGSDYNGTLTSQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVAEPTETFSLTVGGKTGTATIIDNDPVPTVSTVS
SAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAATGQVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEQAENFTLTVGGKTGTATIIDNDAAPTVGSVSSAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGT
VTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEPAENFTLTVGGKTGTATIVDNDAAPTIGTVSSAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTPTTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTTFTVTVPTVDDTVSEPTENFTLTVGGKTGTATIVDNDAAPTIGTVSAAVDSSGGQVDEGD
NAVFTVNLTNASSTPTTFSLVLNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVYEQTETFTLNVGGKVGTATIIDNDPVPTVSTVSSAVDSNGGQIDEGDNAVFTVNLTNTSSTPTTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAATGQVTVPAGVTSFTVTV
PTIDDTVSEPTETFSLTVGGKTGTATIIDNDPVPTVSTVSSAVDNSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTPTTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTIDDSVFEPAENFTLTVGGKTGTATIVDNDAAPTVGSVSSAVDSNGGQVDEGDNAVFTVNLTNASST
PTTFSLTLNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVSEPTETFSLTVGGKTGTATIIDNDAAPTIGTVSAAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTAAAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEPAETF
SLTVGGKTGTATIVDNDAAPTIGTVSAAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTIDDTVFEPTENFTLTVGGKTGTATIIDNDAAPTVGSVSSAVDSNGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLSLNTGTAT
AGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVYEQTESFTLNVGGKVGTATIIDNDPVPTVSTVSSAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTAIAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAATGQVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEQAENFTLTVGGKTGTATII
DNDAAPTVGSVSSAVDSAGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTPTTFSLALNAGTAIAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNSANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVYEQTETFTLNVGGKVGTATIIDNDLVPTVKTIDVGQPGTADDNVIEGNNLVFNVTLSNASSTPTVLSFNATGTATANVDYKLNAQSFSN
GVTYDANTGKITVPAGVTSFSVTVQTLADNVVGEPLETVKLDIGGQSATGGIIDGTPDAKDDSYTKVTGLKAEYFGYKEGTGAGNDGANLTNLSQVRQFIDSHKAAATFNATTLDYGNLSNATGLGTGTNLQTFLGVNTTTGNGAKANSLSTDPGDTSDAIIKMSGYINLAAGTYQFRVTADDGYSIRIN
GQVVAEFNNIQSSATATGKTFTIGAANAGPQQIEIIYWDQGGDARLKVEVGQGGNFKVVDSDMLYHVPTTSTLTMDAGDSLTIASSTLLSNDTDPNNDSLSITSVQNATNGTVTLNNGNVVFTPKSGFYGDASFQYTISDGKGGSDTATVTLKVNQAANVIHVAGDGTNDNGNNTINGGAGSDVLLGDAG
GTLTTLQPATNYNIALLVDTSGSMQGDRMSLTKTALSNFVKTLAGHDGVVNVTLVGFAEKVTLTAKVEDLQSGTSLDALLANIQKLTASGGTNYEAAFKEASAWFDAQSTAGHTKAAGYENLTFFLSDGDPTLYYNGNTTQTSGPGSSTNDQVLLGSLDTFNVLAGKSAVQAIGIGSGVSQKNLSLFDNT
TDTPAFSYLANGFGATLANFNNDTTGWNNLGNWDIAGTGFFSGSAGRSSDALMIRDTAGGSPVTATTPSLTIADGTFSSLRFAYGTADTTASDVLSWKVQQLVKGAWVDVQTGGGTTGGNWTTAETSVLGAGTYRMTFSVDDKSALSANATMWIDDITRVDYTKVPVGKVEIVNSADELSVALHGGANAN
VPVSVGNDTIFGGDGNDIIFGDVINTDALPWGVNGNPAKPADMYNGSGVKALETFLELKNGVAPTNADLYDYIRANHDTFNVAGDTRGGADKLYGGNGNDILYGQGGNDLLVGGAGDDILFGGAGADTFAWQKGDFGKDVIKDFNVAEGDTIDLSSLLQDHSNNLDSYLKLVTDNGSSTLLISTKGEFNN
ADTTTQQVAAKADVQIDLGQASLPSYDINTLIANHTIKVDP

Molecular weight: 515.19 kDa
Isoelectric point according different methods:

Protein with the highest isoelectric point:

>tr|F6AB90|F6AB90_PSEF1 50S ribosomal protein L34 

MKRTFQPSTIKRARTHGFRARMATKNGRAVLSRRRAKGRARLTV

Molecular weight: 5.1 kDa
Isoelectric point according different methods:

General Statistics

Number of major isoforms	Number of additional isoforms	Number of all proteins	Number of amino acids	Min. Seq. Length	Max. Seq. Length	Avg. Seq. Length	Avg. Mol. Weight
4,416	43	4,459	1,436,884	31	5,320	325.4	35.6 kDa

Amino acid frequency

Ala	Cys	Asp	Glu	Phe	Gly	His	Ile	Lys	Leu	Met	Asn	Gln	Pro	Arg	Ser	Thr	Val	Trp	Tyr
11.48	0.96	5.37	5.86	3.55	8.02	2.18	4.76	3.26	11.94	2.3	2.87	4.63	4.79	6.63	5.73	4.73	7.11	1.4	2.43

Note: For statistics only major isoforms were used (in this case 4,416 proteins)
For dipeptide frequency statistics click here

See this proteome in:

Proteome-pI is available under Creative Commons Attribution-NoDerivs license, for more details see here

Reference: Kozlowski LP. Proteome-pI: proteome isoelectric point database. Nucleic Acids Res. 2016. doi: 10.1093/nar/gkw978

Contact: Lukasz P. Kozlowski