Pseudomonas fulva (strain 12-X)

Taxonomy: cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas putida group; Pseudomonas fulva

Average proteome isoelectric point is 6.43

Get precalculated fractions of proteins

Acidic
pI < 6.8
6.8-7.4
pI > 7.4
Basic
    
All


Virtual 2D-PAGE plot for 4,459 proteins (isoelectric point calculated using IPC_method)

Get csv file with sequences according given criteria:
        -     Method 

     -  kDa    
                                                                                      

* You can choose from 18 different methods for calculating isoelectric point

Protein with the lowest isoelectric point:
>tr|F6AAV6|F6AAV6_PSEF1 Type 1 secretion target domain protein
MSNFAAVIKSLIGQVFVTSVDGVRRQVFEGDRIFAGEQVTTADGGSVTLEMANGETVKLGANASWQAGNPDAQEVADSASQAPVSEFEQALAAGMDPTVDLDPTAAGPGAGGGGGSAGGGHSAVMLSETAQRVDPTIGFQTTGLGTPGFNLIEDNNPAIFATADAADTGTTTPDTTAPVVTIGINPITGD
DILNSAELGAATVTITGTVGGEAKVGDAITLNLGGNVYNGTVIALGNGALGFSIPVSSADLGSFNSISATVSSSDAAGNVGTATASRPYTVDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGSTVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNIGSATDTGAIDTTAPVP
TISLDANITPDDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKNFTGQVQADKTFSINVPGADLVADAGKTINASISTTDAAGNLGSAATSEGYSVDVTAPVPTISLDANITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKTFTGQVQADKTFSINVPGADLVADAGKTINASISTTDA
AGNVGSAATSEGYSVDVTAPAPTITLDANITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKDFTGSVATNPNGTLGFSINVPGADLVADAGKTINASISTTDAAGNIGTATDSEGYRVDVTAPAITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPAGSTVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPL
AEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPAGSTVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGSTVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYS
VDAKATDAAGNTGSATDTGAIDTTAPLITVDAPAVTNDTTPTIVGTTDAPVGSIVTLTVTQGSTVITVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGNTVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVT
DAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPSIVGTTDAPIGSVVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPVGSTVILTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNI
GSATDTGAINTTAPVITVDAPAITNDTTPTIVGTTDAPAGSIVTLTVTQGSTVISVTTPVLANGTYSVELNQPLAEGPYSVDAKVTDPAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPAVTNDTTPTIVGTTDAPVGSTVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDT
GAIDTTAPVITVDAPAVTNDTTPTIVGTTDAPVGSIVTLTITQGTTVLTTTAIVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDTGAIDTTAPVITVDAPTITNDTTPTIVGTTDAPVGSIVTLTITQGTTVLTTTATVVAGGTYSADVPAGLVEGPYSVDAKVTDAAGNTGSATDIGAIDTT
APVPTISLDANITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLNVNGKTFTGQVQADKTFSINVPGADLVADASKTINASISTTDAAGNIGTATDSEGYSVDVTAPVPTISLDANITADDVINSTEATEQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLSVNGKTFTGQVQADKTFSINVPGADLVADAGKTINASIS
TTDAAGNIGTATDSEGYSVNTTLPVPTITLDTNITADDVINSTEATQQIPVTGTVGGDAKVGDTVTLTVNGKQFTGQVQADKTFSINVPGADLIADAGKTINASISTTDAAGNIGTATDSEGYSVDVTPPSAAIDIVKISEDTGTPGDFVTRDNTLTVSGTVGPLASGEKAQISVDGGNTWTDLNVNNGT
WDYTDGRTLSLGDHTYQVRVVDAAGNLGSTDTQKVTIIANQNPVAVNDPGNAAGLTGQYYAYHEGTNLDGPNLSSLAQVRAFIDANSPDASFVAKNINYSLGGGDLGGNNNLQTFLGSDAASLNVDPENSSDAIIKLSGTLQLQAGSYQFQVRADDGYSISIDGVIVSRFDGNQSPSTNSGSFTISEPGA
HTIEIIYWDQGGQAALQPTLSFAGGAYQPLSNFSPTQANPALVTGHDNALTISQATLLANDSDADGDTLRIVGVDNPKHGTVTLNDNGTITFTPASNYYGPASFSYTVSDGNGGTSTATVTVNVTGDAAPSIGAVSNAVDSSGNQVDEGDNAVFTVNLSNASITSTTFSLSLNAGTAKAGSDYNGTLTNQ
SFSNGVTYNTANGTVTVPAGVSSFTVTVPTINDTISESTETFSLTVGGKSGTATIIDNDGVPTVSAVSSAVDSTGGQVDEGDNAVFTVNLTNAGSTPTTFSLSLNAGTATAGSDYNGTLTSQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVAEPTETFSLTVGGKTGTATIIDNDPVPTVSTVS
SAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAATGQVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEQAENFTLTVGGKTGTATIIDNDAAPTVGSVSSAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGT
VTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEPAENFTLTVGGKTGTATIVDNDAAPTIGTVSSAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTPTTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTTFTVTVPTVDDTVSEPTENFTLTVGGKTGTATIVDNDAAPTIGTVSAAVDSSGGQVDEGD
NAVFTVNLTNASSTPTTFSLVLNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVYEQTETFTLNVGGKVGTATIIDNDPVPTVSTVSSAVDSNGGQIDEGDNAVFTVNLTNTSSTPTTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAATGQVTVPAGVTSFTVTV
PTIDDTVSEPTETFSLTVGGKTGTATIIDNDPVPTVSTVSSAVDNSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTPTTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTIDDSVFEPAENFTLTVGGKTGTATIVDNDAAPTVGSVSSAVDSNGGQVDEGDNAVFTVNLTNASST
PTTFSLTLNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVSEPTETFSLTVGGKTGTATIIDNDAAPTIGTVSAAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTAAAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEPAETF
SLTVGGKTGTATIVDNDAAPTIGTVSAAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTATAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTIDDTVFEPTENFTLTVGGKTGTATIIDNDAAPTVGSVSSAVDSNGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLSLNTGTAT
AGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVYEQTESFTLNVGGKVGTATIIDNDPVPTVSTVSSAVDSSGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTATTFSLALNAGTAIAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNAATGQVTVPAGVTSFTVTVPTVDDTVFEQAENFTLTVGGKTGTATII
DNDAAPTVGSVSSAVDSAGGQVDEGDNAVFTVNLTNASSTPTTFSLALNAGTAIAGSDYNGTLTNQSFSNGVTYNSANGTVTVPAGVTSFTVTVPTINDTVYEQTETFTLNVGGKVGTATIIDNDLVPTVKTIDVGQPGTADDNVIEGNNLVFNVTLSNASSTPTVLSFNATGTATANVDYKLNAQSFSN
GVTYDANTGKITVPAGVTSFSVTVQTLADNVVGEPLETVKLDIGGQSATGGIIDGTPDAKDDSYTKVTGLKAEYFGYKEGTGAGNDGANLTNLSQVRQFIDSHKAAATFNATTLDYGNLSNATGLGTGTNLQTFLGVNTTTGNGAKANSLSTDPGDTSDAIIKMSGYINLAAGTYQFRVTADDGYSIRIN
GQVVAEFNNIQSSATATGKTFTIGAANAGPQQIEIIYWDQGGDARLKVEVGQGGNFKVVDSDMLYHVPTTSTLTMDAGDSLTIASSTLLSNDTDPNNDSLSITSVQNATNGTVTLNNGNVVFTPKSGFYGDASFQYTISDGKGGSDTATVTLKVNQAANVIHVAGDGTNDNGNNTINGGAGSDVLLGDAG
GTLTTLQPATNYNIALLVDTSGSMQGDRMSLTKTALSNFVKTLAGHDGVVNVTLVGFAEKVTLTAKVEDLQSGTSLDALLANIQKLTASGGTNYEAAFKEASAWFDAQSTAGHTKAAGYENLTFFLSDGDPTLYYNGNTTQTSGPGSSTNDQVLLGSLDTFNVLAGKSAVQAIGIGSGVSQKNLSLFDNT
TDTPAFSYLANGFGATLANFNNDTTGWNNLGNWDIAGTGFFSGSAGRSSDALMIRDTAGGSPVTATTPSLTIADGTFSSLRFAYGTADTTASDVLSWKVQQLVKGAWVDVQTGGGTTGGNWTTAETSVLGAGTYRMTFSVDDKSALSANATMWIDDITRVDYTKVPVGKVEIVNSADELSVALHGGANAN
VPVSVGNDTIFGGDGNDIIFGDVINTDALPWGVNGNPAKPADMYNGSGVKALETFLELKNGVAPTNADLYDYIRANHDTFNVAGDTRGGADKLYGGNGNDILYGQGGNDLLVGGAGDDILFGGAGADTFAWQKGDFGKDVIKDFNVAEGDTIDLSSLLQDHSNNLDSYLKLVTDNGSSTLLISTKGEFNN
ADTTTQQVAAKADVQIDLGQASLPSYDINTLIANHTIKVDP
Molecular weight: 515.19 kDa
Isoelectric point according different methods:






Protein with the highest isoelectric point:
>tr|F6AB90|F6AB90_PSEF1 50S ribosomal protein L34
MKRTFQPSTIKRARTHGFRARMATKNGRAVLSRRRAKGRARLTV
Molecular weight: 5.1 kDa
Isoelectric point according different methods:






General Statistics

Number of major isoforms

Number of additional isoforms

Number of all proteins

Number of amino acids

Min. Seq. Length

Max. Seq. Length

Avg. Seq. Length

Avg. Mol. Weight

4,416

43

4,459

1,436,884

31

5,320

325.4

35.6 kDa

Amino acid frequency

Ala

Cys

Asp

Glu

Phe

Gly

His

Ile

Lys

Leu

Met

Asn

Gln

Pro

Arg

Ser

Thr

Val

Trp

Tyr

11.48

0.96

5.37

5.86

3.55

8.02

2.18

4.76

3.26

11.94

2.3

2.87

4.63

4.79

6.63

5.73

4.73

7.11

1.4

2.43

Note: For statistics only major isoforms were used (in this case 4,416 proteins)
For dipeptide frequency statistics click here
See this proteome in: uniprot_link
Proteome-pI is available under Creative Commons Attribution-NoDerivs license, for more details see here

Reference: Kozlowski LP. Proteome-pI: proteome isoelectric point database. Nucleic Acids Res. 2016. doi: 10.1093/nar/gkw978       Contact: Lukasz P. Kozlowski