Verrucomicrobia bacterium IMCC26134

Taxonomy: cellular organisms; Bacteria; PVC group; Verrucomicrobia; unclassified Verrucomicrobia; unclassified Verrucomicrobia (miscellaneous)

Average proteome isoelectric point is 7.13

Get precalculated fractions of proteins

Acidic
pI < 6.8
6.8-7.4
pI > 7.4
Basic
    
All


Virtual 2D-PAGE plot for 2,622 proteins (isoelectric point calculated using IPC_method)

Get csv file with sequences according given criteria:
        -     Method 

     -  kDa    
                                                                                      

* You can choose from 18 different methods for calculating isoelectric point
Protein with the lowest isoelectric point:
>tr|A0A0E3YS49|A0A0E3YS49_9BACT Uncharacterized protein
MKSRRSSSLSLNRNRRSAVAALGTVALTAGAMFSPLTGSAATQFWNSATAVGDWDVATTANWTGGTTWTNGNVANFTGSNKTIEIVGSIQVSGITVSAVASFNDTDVSGDSITFIGTTRFINSPETFNPGNPLGNQFNDGNTLSFNLPISSDGTSALTINSVVNPDATLNGEQSKPGEIILNADNTGVLG
DVIVNAGTLTLGTNGRLNNVSSVEVKANITPTLTTVLNLTARESIADTATLTNAGVVNLNGSDADATTDDETVASLVNSGTINGNGVGNTLVAATYALNDGSIINANLGNGIVTANGTVALNGTVGHTAAGNASVINVNSGTTTLANTAFSGDVNVDAGTLTLTAAPAAGLTEAITVDITNDGTINTGAS
EQIADTADVSVDGTLHLHTFTETVAGVTLVAGTIDADTVGAATLTGTSFAVESGTVNAILSGAAIDLTKSTGGTVTLNAQNTYTGDTFVNAGTLVLGDATNTLDNATDVVVNGGELALGANTDTVNGVSLQSGSITGTGSATEGVLTSLTDFDVRSGSASANLAGAVGLTKTTVGTVTLTGQNAYTGTTT
VSDGTLEVTGSGTIAASNVIDIATGATLSTDGGALSQDAIVTSAGTGTLALTGSETIKGLNGTGQVNLDAATLTVDTDGNGGAAVDSAYDGVIADATGVGTLTKDGAGSFFLTGANTYTGVTTVNGGTLSIVSGSLSSTDIQVNNAGNFTTDGGLTDAAQVTLNTVASVLRVVGNEQIDRVTGTGTVRIS
DAGDDGAGNDGFTLAISSSTDSTFDGVIVDDNATSAGNLTKSGSNKLTLAGANTYTGTTSVTAGTLALEGTSGSLILNISSGATLTTNPGDLLANTADMTNDGTVEIGGDDLIGTYTGSGTLDGTGNTLTATTYTLNTGSEINANIGTGAVTVNGDTTLNGASDASTVDILGGTLTTGSDEYRFNTSVAI
TVTSPGILALGGNEQAGNIGGTGDVQLGSFGLELYSLNTKTLSGVISGDDSSYFEVYNGGTQTISGANTYTGDTSVFGGSTLILGGTNQSAYYHVSGTSILTANGADRISNTAEVEVDGTYNVQGNDTIGSLSGFGSVVLGGNTLTFNGNGDGTADEELATFDGVISGAGGQIVKTGDDIQVLSGANTYT
GDTEINAGTLRITNSAALGGGAGTTTVFSTGTLQLSNGISISESLDLAGAGQAVTYTGNDSDLTNRGALNNLSGINTVTNQINIGNAAGTATTIAADAGTLNLTGDILGNGGTPTLTFQAAEGASIVVTGSTPAIMLGAGIKDLTKTGRGTLDLSDVAGNASTGDLYLNDGRVIVDAQTDLGGSKVIFGS
TDRGTLVVENNAFVSQYTYAVGASSGAWEDFKSTQFDFSNFGTIETNKNVAIKYSNILPFGLGAGKMIKEGAGDLLIDLDFINSVLPTIQANLGDIYFEDLPVTIAVNGLDGDGTLANGDLQLVSTNLIVNQAVNTNPVEYTGNITTTGDIEINVINGAETFELSGNLTFGELAVVSASTNPVTFSGSLI
SSGDITVTADSDANPDNNTLTLRTPGSLSFPLTNAVPYTFPNPDVAEVIFSGDNPGFTGVFTVTGGDGLVHVIQAPGDTTLGSSLASDNTVIQEGGALELSSGNVAQTTTFNERFTMSGGSRLLLNDPVIVAGTTTVLMGTGDIADIGSVSAAQVTADIFTGNIITIEGASVGFNTQPGQVGELQLSGRL
LGFGEVQIGGIGNGAVIIDGGSTNVLNGSTVLNDGANVVVGKNTAFGTSFVTIDSDATINTIGSRTLANGIDISVGTLTIGDTSLTTLADNADADPTNDTANNDLRLTGTIQGFGGLTKGDGTGTLVLAGNSTFVGDLTINGGTVDLTTGSLLTPAVVINANGTLITGGGLSSNVDVTTAANSDFNLVGN
ETVASIGGGGDINLSSKTLTVDNATGGDVSGVITGTGGVTLTAGIQTLSGANTYTGTTTVNGGALILSAASASASLDINAGSITLNGASGATQVDVAFGSTLTTGGVDILSDSAALINAGTMTFGGDDTVASLTNRGTLAGPGTLTSTAGYALNGGSIVNVNLGDGQITTNGTVALNGNSGNGPLSVITG
TTTVAGTSAATVVSVSNGATLATSASDLIADGATVTLSSSGTLTLGGSETFAGLAGQGVVNAGDLTVTTLNGSGSIASTGTVTATSGTFAGNINSGALTKSNAGTLALTGSNTFTGALTVNSGTLDLTTGTVATNTVVIGAAGTLTTGGGLSVNASVTSAGILDLAGAETIASITGAGAVTLNDKTLTIA
NAAGGDVSGVVSGTGGVTLTAGTQTLSGANTYTGTTAVNGGALTLSGASASLTLDVNGGTLNVNSTSDATSADISTGATLTVGAGGDLTNSIVIGNAGTFTLNSAQTIGTITGAGAVGLNANTLTIGAGSGVASGVFSGTGGITLNAGEITLSGANTYTGATTVTAGTLTFTNASASATIAVNGGVFNTS
GDLAANAAVTVAGGAIANFNVSDTFGSLANNGTVNVNGAGTILNVNTYTQTNGILAGAGKIVASSYDLSQISVSADTTLGAGTLNINGNTLLNGTSLANTVNVATATTLTTGSAERLSDASTVTLTGTGALLLGGAETIDTLAGAGTVNSASNFTVTNLNGSSTITLTGPSTLTASAGAFAGVLADGALT
KVSTGTLTLTGTSTSTDALNVNAGTLAVNGANASTVIGVAAGATVTTNGADHFANTAALTNAGTVTLGGDDTIGSLVNSGTVSGAFTLTAATYALNNGSNVSANLGAGVITTSGTVSVTGNTGAGTVNVSDGTTTLAGTTAATSVNVNGGTLSVTGTINSATSVFIDADANLTTSGANKIGDTAFVTNGG
TLALGGSDTIGRITGAGDIVLGASTLTIANATAGDNVAGSISGTGGLTLTAGSQILSGANSYSGATNVNGGSLALTGSLASTTVNVAAGSSLSSTGGLADGTALANSGSVTFTGGETLASYSGAGSLTATGQDVAVTGTVSSTGTISVNDFNVGTLNGSSAITSTGTVTAASGSFAGNILSGNLVTTGSL
TLTAVNATSGTVEVTAGTLALNATNALQNVSSITVDGGAALSTNGADRINNSAALINDGTVTLGGNETIGSLVNSGTVSGGFTLTAATYALNDGSVINANLGTGTISTSGTVAINGTTGAGGTINVADGTTTVANTSLATTVNVNGGTLSVTGTINSATSVFIDGDATLITSGSAKIGDNAVIANAGLLT
IGGNETVDSITGSGDIVLGSNVLTIDNSVSGANISGTVQGLGSVQLTGGSLTFSGANTYTGGTLVTGGATLVLAHDGNTLSNTGTLTVGQGISTGNVVLNTNTDTVGPVVLVTGTITGTSDIGAFGYGNQGVLTSTGDNFTVQLGSISASLAGNVGLDKVDNVSTGGADTVTLSGVNTYIGDTTITSGTL
VLGHATSTLADDNDVTINGSTAVLALLGNTDSVGTVVLVDGSITGTGNGTAGVLTATEANFDVRNGTVTATLAGNFGLDKTTAGTVTLNNTQAYTGDTTVQAGTLTVNGSLSDVTDVSVSSGATLNYNASDTFATLTNSGAVNLANNVVLTVGTVTQNAGTLGAAVNTGDSIVASIYNLNGGTVHTDLGA
GTVNVGGNTTLNGSSLASTININAGTLTLGSGQRLLDTVAVNFDTANTGGLILGGNETIGSLAGGTSVDSVNMAGFTMTLGGNGDATVDSTSFAGVISNGTLTKTGIDTQVLSGANTYTGTTTVSAGTLTLDGTSQSATLVVNGGNLNVNASSAATTASVSSGSLTTNNGSLLDSIDVTITGGTFAVTGG
NETIDALSGTGGSVSIASDTTLSVGSDNGSASYSGVITGFGGLTKIGAGTETLSGANTYTGATLVSAGTLTVDGSLAQTDITVASPATLNYNASDTVSSLTNSGAVNLGAGVVLSVTTLNQNAGTLGALVAGDSITATDYNLNGGTVQTDLNAGTVNVGGSTTLNGNSLAATVNINTGTLTLGSGDRLLD
TAAVSFDTTTTGGLTLGGAETIGSLAGGNSADSLTLGAFALTIGGNGNGTAETTSFGGVIKGTGSVIKSGLDTQVLTGTSTYTGTTTVTGGILKVDGSIASSATTVATGAKLMGSGTVGALTVASGATLAPGSSPGTLTVSGNWSQSGTYQAELASASSFDQVVVSGTTALNAGSTLALTKLSGFEATLG
QPFQIIDSTGAISGQFATVTSDFTTGLLFDLSDGTLYGTGLTGVGASKQVDLTQLAGLNSNSQAIVSAVQADALVGDPANGVQFKSSTSSGAVLRALLTSGSPATTANQLSPETYAGDTNYAIRVSRNYASTARSLDPVLKTAKFSLFAGYSSYSSGTESSLNQADYDLTSSGALVGASVAVGSKTTVGV
FGAFDNGDIKSTFRNGNTDGQVYGVFGDYVVNDKNNFKLSASLTSGSFATDSTRTTALGTATARSVDSDAMGGSIGASYTAIKTKQYAVSPYASVNYTKGSTNGFTETGSADALTVRDIDYTSVEGEIGARGYYLFTRTFAFTGGLGISQEFGDRNTDVTGGFDTTSYTVRSGGVGSTALSGSIGFSAAL
TRVLTLDAGYKGSVVNDGKTASSVFIGGSMKF
Molecular weight: 445.53 kDa
Isoelectric point according different methods:





Protein with the highest isoelectric point:
>tr|A0A0E3UJE1|A0A0E3UJE1_9BACT 50S ribosomal protein L34
MSPTFRPHKLKRARKIGYRARKATRGGRKVLASRRAKGRKRLTVV
Molecular weight: 5.22 kDa
Isoelectric point according different methods:





General Statistics

Number of major isoforms

Number of additional isoforms

Number of all proteins

Number of amino acids

Min. Seq. Length

Max. Seq. Length

Avg. Seq. Length

Avg. Mol. Weight

2,605

17

2,622

1,004,630

41

13,856

385.7

41.7 kDa
Amino acid frequency

Ala

Cys

Asp

Glu

Phe

Gly

His

Ile

Lys

Leu

Met

Asn

Gln

Pro

Arg

Ser

Thr

Val

Trp

Tyr

12.1

0.91

5.12

4.99

3.92

8.42

2.1

4.8

3.6

10.61

1.72

3.21

3.01

5.28

6.36

6.17

6.54

7.21

1.47

2.47
Note: For statistics only major isoforms were used (in this case 2,605 proteins)
For dipeptide frequency statistics click here
See this proteome in: uniprot_link
Proteome-pI is available under Creative Commons Attribution-NoDerivs license, for more details see here

Reference: Kozlowski LP. Proteome-pI: proteome isoelectric point database. Nucleic Acids Res. 2016. doi: 10.1093/nar/gkw978       Contact: Lukasz P. Kozlowski