Proteome-pI - Proteome Isoelectric Point Database statistics

Ralstonia solanacearum (strain GMI1000) (Pseudomonas solanacearum)

Taxonomy: cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Ralstonia; Ralstonia solanacearum

Average proteome isoelectric point is 7.2

Get precalculated fractions of proteins

Acidic

pI < 6.8

6.8-7.4

pI > 7.4

Basic

All

Virtual 2D-PAGE plot for 5,002 proteins (isoelectric point calculated using IPC_method)

Get csv file with sequences according given criteria:

* You can choose from 18 different methods for calculating isoelectric point

Protein with the lowest isoelectric point:

>tr|Q8XQP2|Q8XQP2_RALSO Probable hemagglutinin/hemolysin-related protein 

MVSPSVLSNHTDIPVTSTTTFVTAPNGPANFLVAAHKDDVANYARSGNDLVVEFKDGHALRLQGFFANGTDFHNLVFQQEDGRMLAVFDGALTAEGDGIVDSAVTLEAIAESSSTATLLGILGAVGLGAGIAAAGGGGGGGSTAAVGAGTGSGSVAPPASVSVDSVDGRTAGSGVVTTNASPAVTGSGAV
PNAQVTVSVDGQSTGTVTADANGNWSYALTSLSDGSHQVTAIQTDSSGTSSAPTAVAFTVDTVAPASPVVASVTDDVDPVTGAIVSGSSTNDATPTLAGTAEAGSTITVYDNGTAIGTATADASGNWTFTPATALADGSHSITVTATDAAGNVSPATSAITLTVDTAAPTAPTLNPSDGTTLSGTAEAGS
TVSLDLNGDGTPDATVTADASGNWTYTPTTPLADGTVVSATATDPAGNVSPAATVTVAPTGTTLAAPVISTVTDDVAPVTGAITAGSSTNDATPTLTGTAEASSTVSVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATDTAGNVSTASSAFALTVDTAAPATPVVASVTDDVAPVTGALTSG
GSTNDATPTLAGTADPNSTISIFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATDPAGNVSTATSAFTLTVDTAAPATPVVASVTDNVAPVTGTLTSGGSTNDTTPTLAGTAEASSTVSVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATDTAGNVSTASSAFALTVDTAAPATPV
VASVTDDVAPVTGALTSGGSTNDATPTLAGTADPNSTISIFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSLSAAATDAAGNVGAASSAFTLTIDTAAPAIPVISTVTDNVAPVTGDITAGGSTNDTTPTLAGTAEANSTVSIFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALADGSHSLTATATDATGSVSP
ATTAFTLTVDTAAPATPVISSVTDDVAPVTGAITSGSSTNDATPTLAGTAEANSTVSIFDGTTLLGTTTSDASGSWTFTPTAALTDGSHSLTATANDAAGNVSTASSAFTLTVDTATPATPVISTVTDNVAPVTGAITAGSSTNDPTPTLAGTAEANSTVSVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALAD
GSHSLTATATDATGSVSPATTAFTLTVDTAAPATPVIGTVTDDVAPVTGAITAGSSTNDATPTLTGTAEADTTISIFDGTTLLGTTTADALGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATDAAGNVSAATSAFILTVDTATPATPVISTVTDNVAPVTGDITAGGSTNDAMPVLTGTAEANSTISIFDGTTLLGTT
TADASGNWTYTPTTALADGSHSLTATATDAAGNVSTATSAFTLTVDTAAPATPVISAVTDAVAPVTGTLTSGGSTNDPTPTLAGTAEANSTISILDGTTLLGTTTADASGNWSFTPTTALADGNHSLTATATDAAGNVSTATSAFTLTVDVSVPLAPVLVSVTDDVSPVTGTLTSGGSTNDATPTLAGTA
EADTTVSIFDGTTLLGTTTADALGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATDATGSVSPATAAFTLTVDTAAPATPVIGTVTDDVAPVTGAITAGSSTNDATPTLTGTAEANSTINVFDGTTLLGTTTSDASGNWTYTPTAALTDGSHSLSATATDATGSVSPATAAFTLTVDTAAPATPIIGTVTDDVAPVTGA
ITAGGSTNDATPTLTGTAEANSTVSIFDGTTLLGTTTADASGNWSYTPTTALTDGSHSLTATATDAAGNVSPATSAFTLTVDTAAPATPVISAVTDAVAPVTGTITSGGSTNDAAPTLTGTAEANSTINVFDGTTLLGTTTADALGSWTFTPTTALIDGSHSLTATATDAAGNVSTASSAFTLTVDTAAP
ATPVIGTVTDAVAPVTGTITAGGSTNDANPTLTGIAEGNSTVSIFDGTTLLGTTTADASGNWSYTPTTALTDGSHSLTATATDAAGNVSSASSAFTLTVDTAAPAAPVIGTVTDDVAPITGTVAAGGSTNDTTPTLAGTAEANSTINVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPSTPLTDGSHSFTATATDAAG
NVGTASSAFTLTVDTDAPTIPVISTVTDSVAPVTGAITAGGSTNDAMPVLTGTAEANSTISVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATDPAGNVSTTSSAFALTVDTTAPAAPVITTVTDAVSPVTGAITAGGSTNDAAPALTGTAEAYSTISVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTT
ALTDGSHSLSATATDATGNVSTASSAFTLTVDTDAPATPVISTVTDDVAPVTGAITAGGSTNDATPTLAGTAEANSTVSIFDGTTLLGTTTADASGSWTFTPTTALTDGSHSLTATVTDAAGNVSTASTAFTLTVDTAAPAAPVLNPTTGTTLSGTAEANSTISVSDGTTLLGTTTADASGTWTYTPTTP
LASGTVVSATATDPAGNVSPAATVTVTAVNTAPAAPVISTVTDDVAPITGAITAGGSTNDATPTLTGTAEADSTISVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSLTATATNATGDVSPASSAFTLTVATAAPATPVITTVTDDVAPVTGAIAAAGSTNDATPTLAGTAVANSTVSVFDGTTLLGT
TTADASGNWTFTPTTALTDGSHSFTATATDAAGNVSAASSAFTLTVDTAAPATPVVGTVTDSVAPVTGAITAGGTTNDATPTLTGTAEANSTISIFDGITLVGTTTADASGNWTFSPTTALADGSHSLTATATDAAGNVSTASSAFALTVDTAAPAAPVLVSVTDNVAPLTGTIAAGGATNDATPTLTGT
AEANSTISVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTSLADGSRSLTATTTDTAGNVSTASTAFTLTVDTDAPPTPVITTVTDNVAPVTGAVTAGGSTNDATPTLTGTAEAHNMISIFDGATLIGATVADASGNWTFTPIQPLADGNHSLTATATDPAGNVGTASSTFTLTVDTAAPAAPVISTVTDNVAPVTG
AITAGGSTNDAMPVLTGTAEANSTVSILDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALTDGSHSITATATDAAGNVSTASSAFAMTVDTAAPATPVITTVTDDVAPVTGAITAGGSTNDATPTLTGTAEANSTISIFDGSTLLGTVTADASGNWTYTPTTALADGSHSFTATATDAAGNVSTATSAFTLTVDTAA
PATPALVSVTDDVAPVTGVLTSGGSTNDATPTLTGTAEANSTVSILDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTPLADGSHSLTATATDAAGNVSTATSAFTLTVDTAAPATPVLASVTDDVAPVTGALTSGGSTNDATPTLAGTAEANSTISILDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTALADGSHSLTATATDAA
GNVSTATSAFTLTVDTAAPATPVLVSVTDDVAPVTGVLTSGGSTNDATPTLTGTAEANSTISVFDGTTLLGTTTADASGNWTFTPTTGLTDGSHSLTATATDAAGNVSPATSAFTQTVDTAAPATPALVSVTDDVAPVTGVLTSGGSTNDATPTLAGTAEANSTISILDGTTLLGTTTADASGSWTFTPT
TGLTDGSHSLTATATDAAGNVSTATTAFTLTVDTVAPTTTATLTTLTADTGTTGDWITGDTAPTLSGTVSAALGTGETVQVSLDGGTTWSDAVVSGTSWSWYPVAQFAAGGYTAMTRVVDAAGNAGAASSQAFTIQTTAAPVVSVQQSAGLLGIAGANLFDLIDFSQQQLFAATDYNNNIQSVVLHYGGV
ASLLSTSQYSANSALASELGLQFSVVNNNGILGIAASSTMTITATDGGTIDNLRLNEFLGSVTLSGGGLLGINASLLSSVTIQATDSTSLSSTANAGQLLNVSLLGTTQPSAIIEGTSGNNTLTGTSGNDRLYGYAGDDTLNAGAGNDLLRGGAGNDVLNGGDGNDILIGGAGNDTLTGGAGGDIFLWEV
NAADNTGGNGADTITDFTLASGPDDATADRIDVSALLVGYTADADGAAHYVNGVATIDSGDTIGQYLTATSDGAGNTVITIDRDGAGTTYSATTLVTLTNVTTNLETLLANHQILV

Molecular weight: 395.09 kDa
Isoelectric point according different methods:

Protein with the highest isoelectric point:

>tr|Q8XZ87|Q8XZ87_RALSO Uncharacterized protein 

MVLMLPQARSGAQVRAVRVSAMSRPVASAVRVPVAKVAGKPVARAKPVASASAKRRKR

Molecular weight: 6.08 kDa
Isoelectric point according different methods:

General Statistics

Number of major isoforms	Number of additional isoforms	Number of all proteins	Number of amino acids	Min. Seq. Length	Max. Seq. Length	Avg. Seq. Length	Avg. Mol. Weight
4,974	28	5,002	1,654,857	20	6,889	332.7	36.0 kDa

Amino acid frequency

Ala	Cys	Asp	Glu	Phe	Gly	His	Ile	Lys	Leu	Met	Asn	Gln	Pro	Arg	Ser	Thr	Val	Trp	Tyr
13.43	0.94	5.4	4.89	3.37	8.42	2.32	4.36	2.83	10.31	2.33	2.69	3.89	5.39	7.27	5.32	5.57	7.5	1.41	2.36

Note: For statistics only major isoforms were used (in this case 4,974 proteins)
For dipeptide frequency statistics click here

See this proteome in:

Proteome-pI is available under Creative Commons Attribution-NoDerivs license, for more details see here

Reference: Kozlowski LP. Proteome-pI: proteome isoelectric point database. Nucleic Acids Res. 2016. doi: 10.1093/nar/gkw978

Contact: Lukasz P. Kozlowski