Pelagibacter ubique (strain HTCC1062)

Taxonomy: cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Pelagibacterales; Pelagibacteraceae; Candidatus Pelagibacter; Candidatus Pelagibacter ubique

Average proteome isoelectric point is 7.5

Get precalculated fractions of proteins

Acidic
pI < 6.8
6.8-7.4
pI > 7.4
Basic
    
All


Virtual 2D-PAGE plot for 1,354 proteins (isoelectric point calculated using IPC_method)

Get csv file with sequences according given criteria:
        -     Method 

     -  kDa    
                                                                                      

* You can choose from 18 different methods for calculating isoelectric point
Protein with the lowest isoelectric point:
>tr|Q4FM44|Q4FM44_PELUB Uncharacterized protein
MLDGAGASTFLDLIDERNQEDIKKNSKIIDTTKDNNEVPFANTARDQNKKNVVFIDSAVSDYETIINSFKENTEFYLINSNEDGFKRISEILNDRKDIDGLHIIGHGSAGQILFGNAFLNNDTITNYQSTLASIGQSLTTSGDILFYGCNVASTEQGEILIKKISEITKADIAASDDLTGKGGDWVLEKK
EGLIGEEELKVKNYKHALGSLSSSGVLSNSGVTHIDSNVTMMNSGNVGLGSSGAFATVGSDFGLAVEQQNVSVSSGELISNLDVDSTYIFDDDNDTGDAALQNGANQNASSNITVNSYLMFLVEDINKRASGSAGEVVFDGEIVGIFFDQAKTRAASVGGNTYHSGNLIYAMSGSGGSSNSSDNDGGRMA
EGKKSHTGMTNFFNTTQSHSSSAAIANGSSGSDWVSVSNHGSGTNNLLQFGAQNANVSAGDYIRILVVPNSSDGSATVEEDGSVSVSNGGSASSPDPITVDSGSTLSSSSGSPRRMTFSDDGTKLFVLEHTNDTITTHNLGTAYDISTQTSSVTGTTLASNPHSSSRAYGIAFSNDGTKMFTSDLDTGYV
YQSTLTTPWDVSTNQRSSSDDLNTVSLYGVTASNSLYNRDITFSEDGTKLFILGSDKTVHQISLGTAWDLSSYQTPDVEKDLSSILTDTYANSISFSPNGKKMFINEYNNTIHEFSIATAWDLSSTVTNEGSFQLGTEIASNNFGEVTWNKDGTKLFAIDDLAEDITEYTVSTPFSLANVDQTKSAESIS
TVSSIRTGTVAAGSGTSGSTNTALTGTYGQLTIQSNGSYSYVANQDAADALDPGDIVYDYFTINGDTDLTITVIGINDTPIADNETNSTDVSTTLTVTDGSSDVLAGDTDADADASLTVSAIRTGSSEGSGDAGTIGSALNGSYGALTMNSDGTYTYVASSSAGTDSFNYTVTDEFGATDIATLTITVNS
SNAAPTASNSTVYINENNQVSSAGDRTPSNISKIFAASDFNYSDGDSDSLSKIKITTLESAGVLEYSSNGSSWADVTLNQEITASDISNNKLRFTPAANSESNVTFGFKVHDGTDYSSSAYTMTVSVNAAPNVTDATVGSTVSADGTSSGDVHDGVADSDDADSVLVVTGVASGNESSNNSIVTDNTGVG
SAVSGTYGSLNIAANGTYTYTASSTNNIAYDATATDIFTFTTRDDESNSGSNAYDVGSITFTVASSISLTDDTDSVNEDATITKTGSQDDVLNDDAADTNGLVVTHIKKDGGSNSTVASSSTYTSNGTSVTGTYGTLVIGADGSYTYTADQSAADDLDLNDEVTDVFVYTADGATANLTITVTGINDVPE
AADKTVTTNEDTAYVFSASDFGYTDADDDDALVSVKITGLEDAGALQYNNGSAWVDVTENQVITATDIGNNKLRFNPAANENGSSYTSFDFTVNDGDADSASANTITVNVTAVNDAPVADNETNSVNEDATLTVTDGTSDVLHGDTDTENDALTVTQIAVTGASASSVAGSSTYNSNGTSKTGTYGTLVI
GADGTYTYTADQSAADDLDAGDTATDSFTYTVSDGTATDTATITITVTGINDVPEAADKTVTTNEDTAYVFSASDFGYTDADDDDALVSVKITGLESAGALQYNNGSAWVDVTENQVITATDIGNNKLRFNPAANENGSSYTSFDFTVNDGDADSASANTITVNVTAVNDAPTARGDTGIVNEDVTLTVS
NSSNATTSVTAASFVRSKSLGDAGYQSQETKFSPDGTKMFVLDTYQNTNEIHQYTLTTAFDISSASFDGADETFDLSNENSSSSNFTFNNDGTKFYSAYSGRLYEYDVSTAYDISTSSYNNNFFDLILEYPNTRNMGSGVNVAFNSDGTKLFALDAQQREVHEYSLSTAFDVTSASRTNNYVSVGTQEAS
PYGFAFSNDGKKMFISGLGKDVNEYTLSTGFDLSSTFEFVGSFDVSSKDWYPLGITFNNDGTKMFVTGSQQDKLFEYSLTTPFSLIDVSGEHSGDVINTSSTDNYDTDPEGDALTVTTYSHTSATDQDGGSISSTSSTGTAGTNNVTGYYGTLDLEGNGSYTYTADLTVTQALDSGDTVTDIFTYTVDDG
NGGTDTVTITITVIGMNDAPVAQNDVGVIVEDGTLTVSNGANANVSGSYDATGEHSGDVIDTSSSSHTDSDADASASLTVSAIRTGSSEGSGTAGSIGSALTGTYGQLTIAADGSYSYVANQDAAVGDSVTESFNYTLSDGTATDIGVITITILGVNDAGFIKEGGTLTVANSAAANSGASTGNHTGDIT
DNGSNITSITATTAGGNAQTTFSSNSETVTGEYGTLTINSDGSYSYVANSNISGLDAGDANIKDVFTYIVSDGSTTSTATLTMNIIASQDLTARDDNGTVNEDATLEVDDGDNLTTVAPASYDDSDSFTIAGSDSNPVTTQSTFNDLLFNPDGTKMYTLGSASGLSGRSLFQYTLSIPFDVSTASVSSND
NADVGGSWTTDNEAMRFNNDGTKLFVLFDSPNQNTSSYMYQYTLSTPYDITSTVTAGNSLRLGNQYKNYRTFLFNDDGSEMFISEVSGIYKYTLSTSFDTSTASKTSSYLSASVTGMQYNNDGTKLFTVYQTTTIGSTAKISQWSLSTAYDLMTASSNSTYFDTGEATGSLGNGVPTQFITFNNDGSKFF
SFNGSSDPAKIKEWNLASPFNVVNVSGEHSGDVINTSSTANYDTDPDSDTLTVTAIRTGSSEGSGTVGSVGSALTGTYGQLTIAANGSYTYVANQDAADALDPGDVVTDTFNYTVSDGQGETDIAVLTITVNGINDTPVADAETGSVDTTQTLTVTDGTSDLLHGDTDADASASLSVSSIVATTASGSAT
AVNPGTAYNSGYTSVTGSKGTLRVGADGTYQYIAGSSTGTDVFTYTLSDGTATHTATLTITVNSSNNAPSAVADTDSVNEDATVTQSSGSGLLNADDSDADGDSLTVTQIKKDGGSNSSVSGGSSYNSSGTSVTGTYGTLTVGADGTYTYVADQAAADALDASDTVTDVFTYTISDGNGGTDTANLTITV
TGVNDAPSATNDTGSVNEDATLTVSTASSGVTQDNDTDADADDSASSLVITQIKKDGGSNSSVSGGTNHSNGTSVTGTYGTLVIGANGTYTYVADQDAADALDASDTVTDVFTYTVSDGNGGTDTANITITVTGVNDDPIGVNDTDSVNEDATITESSGSELLVADDTDADDSSSLTVTQIKVTGGSNSS
VAGSSTYNSNFTTVTGTYGTLKVGADGSYTYVADQAAADALDVGDNVTDSFTYTVSDGTATSTATLIITVTGINDVPVAVNDTDAVNEDATITESSGSELLVADDTDADDSSSLTVTQIKVTGGSNSSVAGSSTYNSNFTTVTGTYGTLKVGADGSYTYVADQAAADALDASDTVTDSFTYTVSDNTWFD
TATLIITVTGINDVPEAADKTVTTNEDTPYVFSANDFGYTDADDDDALVSVKITGLEDAGALQYNNGSAWVDVTENQVITATDIGNNKLRFNPAANENGSSYTSFDFTVNDGDADSASANTITVNVTAVNDAPVADDETGAVNEDATLTVTDGTSDVLHGDTDADSDTLTVTTYSHTSATNQSGGNASSA
NGNSGTAGTNAVVGYYGTLTLAADGTYTYAADQSAADDLDASDTATDVFTYTLSDGTATDTATITITVTGINDAPAAVNDTDAVNEDATVTRTSGDNLLMADDSDADDDDSFTVTQIAVTGGSNNAVTASSTYNSGSPETVTGTYGTLTVGANGTYTYVADQSASDDLDASDTATDSFTYTISDGTTTDT
ATLIFTVTGINDVPTAADKTVTTNEDTAYVFSASDFGYTDADDDDALVSVKITGLEDAGALQYNNGSAWVDVTENQVITATDIAANKLRFNPAANENGSSYTSFDFTVNDGDADSASANTITVNVTAVNDAPVADDETNSVNEDATLTVTDGSSDVLHGDTDVDSGDTLTVTTYSHTSATNQSGGNASSA
NGNSGTAGTNAVVGYYGTLTLAADGTYTYAADQSAADDLDASDTATDVFTYTLSDGTATDTATITITVTGINDAPVAVNDTDAVNEDATVTRTSGDNLLMADDSDADDDDSFTVTQIAVTGASNSSVASSSSYNSNFTSITGTYGTLKVGADGTYTYVADQSAADDLDLNDTATDSFTYTISDGDTTDTA
TLIFTVTGINDAPVAVDDTDAVNEDATVTRSSGSSLLMDDDSDADDDDAFTVTQIAVTGSSNNAVTASSTYNSGSPETVTGTYGTLTVGADGTYTYVADQNAADDLDASDTATDSFTYTISDGTATDTATLIFTVTGVNDVPEAADKTVTTNEDTAYVFSASDFGYTDADDDDVLVSVKITTLESAGALQ
YYNGSAWVDVTLNQVITATDIAANKLRLNPATNENGSPYTTFNFTVNDGDADSATPNTITVNVTNVNNAPVADNETNSVNEDATVTVTDGTSDVLHGDTDADSGDTLTVTQIAVTGGSNSSVAGSSAYNSNFTSVTGTYGTLKIGANGTYTYVADQSASDDLDASDTATDSFTYTVSDGTATDTATLIFT
VTGINDAPVAVNDTDAVNEDATVTRTSGDNLLMADDSDADDDDSFTVTQIAVTGSSDNAVTANSTYNSGSPETVTGTYGTLTVGANGTYTYVADQNAADDLDLNDQVTDSFTYTISDGTATDTATLIFTVTGINDAPVAQNDVGVIVEDGTLTVSNGANANLSGSYDATGEHSGDIIDTSSSSHTDSDAD
DSASLTVTAIRVGSSEGSGTAGSIGSALTGTYGQLTIAADGSYSYVANQDEADALDAGDSVTDSFNYTLSDGTATDIGVITITILGANDAPVANNDTGSVNEDATLTVSSASSGVTQDNDTDVDGDDTVSSLTVTQIAVTGSSNSSVTSSTTYSNGTSVTGTYGTLVIGANGTYTYVADQSAADDLDLND
TATDSFTYTVSDGTTTDTATLIFTVTGINDAPVAVNDTDALNEDATVTRSSGDNLLMADDSDADDDDSFTVTQIAVTGGSNSSVNSSTTYSNGTSVTGTYGTLVVGADGSYTYEADQSAADDLDLNDQVTDSFTYTISDGTATDTATLIFTVTGINDAPVAVNDTDAVNEDATVTRSSGSSLLMADDSDA
DDDDAFTVTQIAVTGGSNSSVAGSSTYNNNFTSVTGTYGTLKVGADGTYTYVADQSAADDLDASDTATDSFTYTVSDGTATDTATLIFTVTGVNDVPTASDKTISTAEDTPYVFSTSDFGYTDADDDDALVSVKITTLEDAGALQYYNGSAWVDVTLNQVITATDIAANKLRLNPTADENGSPYTTIGFS
VNDGDADSATPNTITVNVTAVNDAPVADNETNSVNEDATVTVTDGTSDVLHGDTDVDSGDTLTVTQIAVTGGSNSSVASSSSYNSNFTSITGTYGTLKVGADGTYTYVADQSAADDLDASDTATDSFTYTVSDGTATDTATLIFTVTGINDAPVAVNDSDVVNEDATVTQTSGSSLLMADDSDADDDDSF
TVTQIALTGGSNSSVASSSSYNSNFTSITGTYGTLKVGADGTYTYVADQSAADDLDASDTATDSFTYTVSDGTATDTATLIFTVTGINDAPVAVNDTDALNEDATVTRSSGSSLLMADDSDADDDDAFTVTQIAVTGGSNSSVASSSSYNSSGTQVTGTYGTLTVGADGTYTYVADQSAADDLDASDSVT
DSFTYTISDGDTTDTATLIFTVTGINDVPTASDNAVTTNEDTPYVFSASDFGYTDADDDDALVSVKITTLEDAGALQYYNGSAWVDVTLNQVITATDIAANKLRLNPTADENGSPYTTFNFTVNDGDASSSTPNTITVNVTAVNDTPTATDDTASVNEDATTTISSASSGVIDDNDTDPDSSDTLTLTNV
AHTNGNTESVTSSTTYLNGQSITGTYGALTVGADGTYTYVADQSAADDLDASDTATDVFTYTLSDGTATDTATITITITGVNDAPVAVNDTDAVNEDATVTRTSGDNLLMADDSDADDDDSFTVTQIAVTGASNSSVASSSSYNSNFTSITGTYGTLKVGADGTYTYVADQSAADDLDASDTATDSFTYT
VSDGTATDTATLIFTVTGINDAPVADNETNSVNEDATLTVTDGTSDVLHGDTDADDSASLTVSAIRTGAEGGSGTAGSIGSGLTGTYGTLTLASDGTYTYVADQSASDDLDASDTATDVFTYTVSDGTATDTATITITITGVNDAPVAVNDTDAVNEDATVTRSSGSSLLMDDDSDADDDDAFTVTQIAV
TGSSNNAVTASSTYNSGSPETVTGTYGTLTVGADGTYTYVADQNAADDLDASDTATDSFTYTISDGTATDTATLIFTVTGVNDVPEAADKTVTTNEDTAYVFSASDFGYTDADDDDVLVSVKITTLESAGALQYYNGSAWVDVTLNQVITATDISNNYLRLNPTENETGSPYTTIGFSVNDGDADSSSSY
TMTVNVINTNDAPVADNEINSVNEDATVTVTDGTSDVLHGDTDADSDTLTVTQIAVTGGSNSSVAGSSTYNSNFTSVTGTYGTLKIGANGTYTYVADQSASDDLDASDTATDSFTYTVSDSNATDTATLIFTVTGVNDVPTASNNAVSTEEDTPYVFSTSDFGYTDADDDDALVSVKITTLEDAGALQYY
NGSNWVDVTLNQVITATDISNSYLRLNPTADENGSPYTTIGFSVNDGDADSASSYTMTINVTAINDNPVADNETNTATEGTTTTVTDGTSDILYGDTDTEGDTLEISGIRTGTESGSGTFGAIATPLTGTYGSLTINSDGTYSYTPNDVLGSGETGIDYFTYTVSDGNGGTDTGQLTITVTGANDAPVGV
NDSNTIDIAATSTLTVTNDSEKDVLTNDTDPDSNDTSIVTEIRTGSTEGSGTAGTLGEALIGTYGSLIMNSNGSYTYIVNEGLKDTLDPGEIVYEYFNYTVRDGSGVTDTSSIVLKLQNGGGVVKEIREKKAERIIINQARMEARVQVENTFTELNQSTEFDLNNFEFEQTARKTDYSQGLKLVDLVAET
DSLQISEGELSNLKVKDKQEGLKLKFGVMNEADNEIVKFDGKMSDGSALPEWIKINPKTGQTTTNIPEGVDKVEIMIIATDKNNETREIAVEIDPEKIKQDRKIIKQAKRTNSSITVNEDGTVNIVKQNEDGLVERSFNKTLNFNNPADINEIIETFKPETIFQLKPLNIGNDLIIDLPNELKGNFNNTK
LVLKDGTEVPDWLEYDPVTGQIIAENPPEDVSQLELKLIIEQDGKIIVKDLEVDLQEQNVSQNFDGGENNRFVTLSDQLDKEFNDWEDYGNDLINRL
Molecular weight: 754.58 kDa
Isoelectric point according different methods:





Protein with the highest isoelectric point:
>tr|Q4FM45|Q4FM45_PELUB Putative transmembrane protein
MKKITKNIKVKVASNKKKVSGNILNAPKTHKLPRVVKARAGQTITGKIGGIRKTPNKSIAKPGQTITGKIRRRTN
Molecular weight: 8.17 kDa
Isoelectric point according different methods:





General Statistics

Number of major isoforms

Number of additional isoforms

Number of all proteins

Number of amino acids

Min. Seq. Length

Max. Seq. Length

Avg. Seq. Length

Avg. Mol. Weight

1,352

2

1,354

416,212

29

7,317

307.8

34.7 kDa
Amino acid frequency

Ala

Cys

Asp

Glu

Phe

Gly

His

Ile

Lys

Leu

Met

Asn

Gln

Pro

Arg

Ser

Thr

Val

Trp

Tyr

5.71

0.96

5.4

6.03

5.22

6.32

1.57

9.53

10.23

9.39

2.22

6.53

2.63

3.19

3.12

6.92

5.11

5.66

0.91

3.35
Note: For statistics only major isoforms were used (in this case 1,352 proteins)
For dipeptide frequency statistics click here
See this proteome in: uniprot_link
Proteome-pI is available under Creative Commons Attribution-NoDerivs license, for more details see here

Reference: Kozlowski LP. Proteome-pI: proteome isoelectric point database. Nucleic Acids Res. 2016. doi: 10.1093/nar/gkw978       Contact: Lukasz P. Kozlowski