Proteome-pI - Proteome Isoelectric Point Database statistics

Lactobacillus plantarum (strain ATCC BAA-793 / NCIMB 8826 / WCFS1)

Taxonomy: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; Lactobacillus plantarum

Average proteome isoelectric point is 6.88

Get precalculated fractions of proteins

Acidic

pI < 6.8

6.8-7.4

pI > 7.4

Basic

All

Virtual 2D-PAGE plot for 3,088 proteins (isoelectric point calculated using IPC_method)

Get csv file with sequences according given criteria:

* You can choose from 18 different methods for calculating isoelectric point

Protein with the lowest isoelectric point:

>tr|F9UN82|F9UN82_LACPL Cell surface SD repeat protein membrane-anchored 

MKFLRHKSFRGDPQVHYKMFKVGRTWVFTAMASFVLTAAPQLVSHADTVSADTSSDTASSATSSASSGADTSSAAASAAALAAATASSTSTSTTSDSSTASSSSETASNSNSESSSDSSSSDDSASDASSASETSTTNATSTSSTSSSSVSTASSSASSASSSSSSSSSSATSSSLTDSSSSSAASSSTT
SLSSSASVAASTVSTASSVASTTKSASTAASTAAIAAYSSVSAASSHTDSTAAKAASSSASLAGSYATLASSYASLVNNLTTQAAVSAAQSAYQEALNAADLSRHYNSIANMYLDALTNGVGSNVDNAIAYSGANSLAYSAASAASSYAALASTATSTASSAATQGLINLASSNYSAASSAASAATVAAS
SAAEAANSAYLAMQYDKNNTAVTSAYTVASSTAAAASTAAVNATTAAVAASSAYAAVSSNAANNDYEATSTAYAVTSSAATEALGQYAAGSTASSAASFANSTAISDLASAASSSANVANTAKSTASSAASVAATQTGTQASAYASSAATAASSASSAYAVASTAAKSAVSASDPATADSYARVAQSASS
LAASYAATAESNATLAAKFSTDVANEQTVSSNATLTTSTATQSVSTGDTVTITNKVGLDSGYSVSGTPTYVWYVSTDGTTWTTISGATSATYTTTATTSGTYYYQAVVSGKRVTAIILTSSFKAAGNVITIVVTNPEGTYTEIASSYASQANSAASVATSQAVAASSAISLASSSANLTGSLASYYTSQA
NSSYNAASSYASVASEAASIATMASTSAASYEAEGAYTSANIWAGMASSYASVATEYASSASSAASEAAASLDTALKNAVNEDGGDTAADYLASSYASMAASSANVAGDQASLAASYAANAANAYNVAGSSFNTTATSSYNAAASSAAVAASSYAAAASEAASLAASYAADGNYNSAALQQSYAALRLTY
ATDQLNAASSAASAITQTVVQAQSSYYNSIATAASSAASAAESAAGNAISVASSLSAKYASNTTLGSSYVAQTNNYAVTTLGAAAAATSAAEMAAQYTSQASSAVAAGDYAMASSYVTNASAAASEATSYAALSTSNAALGSTAASNATNYSNNTNSYKSTNTGNATTILGIVISGGMTSQPAAVTSTVS
GGTFTLSASSALGLGGVALSSKTTWYVQVNGTWMTLDKASAYIESYDAVDSAGLLSTSSSLTVTIKAGYTGSLLFQAVQGFSWDLANWFTVYTFASNLAEVDVYSSNIPATNISIAGDDYVINPTNSSSGSNDKVTSQFTSTTNPENATGKITWTTSDSSIATIDDSGLLTVVSNGTVTITATITNADGT
SYSSSKTITIGSGLEDTSVDAGSDLTWVPDGSTTGTGTDITYQWYYSSTADGTGTALSGQTGTTLNLSDLTVGQSGYYYLVITGSNTTNGTTTTTTVTLGRAYLTVNAVSTEAADSAASEAANYANQATEYGSVASSYANIAGEYASKNSEASSYAEQATAAASDAQSAATAASTAASNAAAAQSNADSA
EAAGENSAASSYAEEAKKKASEASEAKKKASSAADDAGYYADLAANVSEDDSDSDSDGDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDGDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSNNDSDSDTITDSDSNDGTNSDNGSNSGSDGSSSSNTGSGSGNTTGSTGNNSGTGTGTTTSSTAS
NNGAASTSTTSLSAAATSGVSATAATLAVTTPSSDGAATTSATAATSVVYAAASAQDVDATSDQTDSDSKSSNDSDKDKKSADTDSADDKVGSSNTDENGKTASDTSNNAGTIFGGLLTAAAAAGLGWWFFLFGRRRKDDDEDDENQK

Molecular weight: 334.91 kDa
Isoelectric point according different methods:

Protein with the highest isoelectric point:

>tr|F9ULN0|F9ULN0_LACPL 50S ribosomal protein L34 

MKRTYQPKKRHRQRVHGFRKRMSTSNGRKVLARRRQRGRKVLSA

Molecular weight: 5.4 kDa
Isoelectric point according different methods:

General Statistics

Number of major isoforms	Number of additional isoforms	Number of all proteins	Number of amino acids	Min. Seq. Length	Max. Seq. Length	Avg. Seq. Length	Avg. Mol. Weight
3,077	11	3,088	932,564	29	5,289	303.1	33.6 kDa

Amino acid frequency

Ala	Cys	Asp	Glu	Phe	Gly	His	Ile	Lys	Leu	Met	Asn	Gln	Pro	Arg	Ser	Thr	Val	Trp	Tyr
9.22	0.5	5.66	4.51	3.96	6.65	2.37	6.55	5.15	10.01	2.68	4.41	5.25	3.8	4.29	5.79	7.1	7.39	1.17	3.52

Note: For statistics only major isoforms were used (in this case 3,077 proteins)
For dipeptide frequency statistics click here

See this proteome in:

Proteome-pI is available under Creative Commons Attribution-NoDerivs license, for more details see here

Reference: Kozlowski LP. Proteome-pI: proteome isoelectric point database. Nucleic Acids Res. 2016. doi: 10.1093/nar/gkw978

Contact: Lukasz P. Kozlowski